Tomasz Kościółek

Tomasz Kościółek uzyskał tytuł magistra chemii na Uniwersytecie Jagiellońskim w 2010 r. oraz stopień doktora nauk biologicznych na University College London (Wielka Brytania) w 2016 r. W latach 2016-2019 odbył staż podoktorski w grupie Roba Knighta na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Diego (USA). W latach 2019-2023 był liderem grupy bioinformatyki w Małopolskim Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie. W latach 2023-2024 był profesorem uczelni Politechniki Śląskiej w Gliwicach, zatrudnionym w ramach programu Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza. Od 2024 roku jest Liderem Grupy Badawczej w Sano – Centrum Medycyny Obliczeniowej w Krakowie. Tomasz jest także współzałożycielem onebiome Sp. z o.o. oraz doradcą Human Biome Institute s.a.

Pracuje nad rozwojem i zastosowaniem metod obliczeniowych w celu lepszego zrozumienia funkcji i dynamiki ludzkiego mikrobiomu jelitowego. Przyczynił się do rozwoju zestawu narzędzi powszechnie stosowanych w analizach mikrobiomów – QIIME 2 i Qiita – a także pracuje nad najnowocześniejszymi metodami uczenia maszynowego i statystycznymi do przewidywania funkcji białek (deepFRI) lub modelowania dysbiozy i dynamika mikrobiomu. Celem jego grupy jest zbudowanie wielopoziomowego zrozumienia mikrobiomu od genów, poprzez struktury, po funkcje i terapie.